非盈利性的，有很多地区的民营医院，都是用的公立医院的账务处理方法，是没有设置折旧的。一般来说，民营医院应按企业来设置会计科目。

另外，卫生这一块其实包括了医疗，卫生，行政，医院是按医疗单位来设置科目。疾控，妇幼是按卫生单位来专门设置。在《医院会计制度》中没有明确提出“折旧”的概念，但是规定按固定资产账面价值的一定比率提取修购基金，通过“专用基金、一般修购基金”进行核算。

现行制度会计处理为：在提取一般修购基金时，借：医疗支出、一般修购费；贷：专用基金、 一般修购基金。在固定资产的核算上面，现行的制度存在很多问题，据说马上要改革了。